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定量PCR常见问题是否选定了合适的增益值

发布日期:2015/4/20 9:27:27 阅读次数:5615次

                                                     定量PCR常见问题是否选定了合适的增益值
定量PCR常见问题是否选定了合适的增益值这是一个普遍的问题,根据上海劲马生物做的一些市场了解,一些情况下会看到曲线超过了窗口范围,在荧光强度100的地方成一直线。尽管大部分的数据可以用,但是减少增益,一些原始数据就不会超出范围。有时,在个循环信号就跳出了窗口范围,这是由于增益选得太高,看起来像没有检测到数据。如果熔解曲线分析时,开始荧光就达到了100,则应当用低的增益重新运行,而不需要重新运行扩增反应,SYBRGreenI和FRET的样品可以在一定程度上反复使用。
广义概念下的定量PCR技术可以分为五种类型:
1. 外参法+终产物分析 所谓“外参法”是指样本与阳性参照在两个反应容器内反应。这种类型没有对样本进行质控监测,易出现假阴假阳结果,没有监测扩增效率,定量不准。
2. 内参法+终产物分析 所谓“内参法”是指样本与阳性参照在一个反应容器内反应。这种类型对样本进行质控监测,排除假阴结果,但是定量不准。
3. 外标法+过程监测 这种类型监测扩增效率,阳性样本定量准,但是无法排除假阴结果。
4. 内参法+过程监测 由于样本与阳性参照在一个容器内反应,用同样的Taq酶和反应参与物,存在竞争性抑制,起始模板量浓度高的反应会抑制起始模板量浓度低的反应,所以定量不准。
5. 外标法+过程监测+内对照 这种类型监测扩增效率,阳性样本定量准,同时排除假阴结果。这种类型是应该提倡的。 PCR过程的监测有多种检测模式。*常用的有三种检测模式,见下面检测模式的内容。
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